Daley bắt đầu đóng phim khi anh được mời đóng vai "Young Tommy" ở Mỹ và các chuyến lưu diễn quốc tế của bộ phim hit Broadway có tựa The Who's Tommy. Anh thủ vai Sam Weir, nhân vật chính trong phim "Geeks" trong loạt phim truyền hình Freaks and Geeks, và từ đó anh đã làm việc liên tục trên truyền hình, bao gồm các bộ phim như The Geena Davis Show, Boston Public, Regular Joe, Kitchen Confidential, Juding Amy, và thành phố Spin. Anh đã đứng thứ 94 trên 100 ngôi sao teen lớn nhất của VH1.

Năm 2001, anh đồng đạo diễn một bộ phim ngắn mang tên What Babies Do. Anh cũng đã viết và đóng vai chính trong bộ phim hài đêm thứ sáu. Năm 2005, anh đã diễn xuất trong bộ phim Friday Night. In 2005, he appeared in the film Waiting... và hài kịch tình huống Fox tựa Kitchen Confidential.. Trong năm 2007, Daley tham gia diễn viên của bộ phim truyền hình Fox Bones, mô tả nhà tâm lý học Lance Sweets. Ông đã đồng sáng tác tập "The Truth in the Myth" với Jonathan Goldstein, tác giả của bộ phim Stephen Nathan, cho biết Sweets đã bị giết vì Daley muốn có thời gian để chỉ đạo một bộ phim và ông lo ngại rằng Sự vắng mặt của Daley sẽ là quá dài, đặc biệt nếu công việc chỉ đạo đã dẫn tới những tác phẩm khác.

Trong năm 2011, Daley và bạn diễn của mình là Jonathan M. Goldstein đã viết bộ phim đen Horrible Bosses. Năm 2013, Daley đồng sáng tác The Incredible Burt Wonderstone với Goldstein; Daley cũng có một cameo trong phim như một nhân viên y tế. Năm 2013, cả hai được thuê viết Call of the Wild cho DreamWorks Studios.[8] [liên kết chết] John đóng vai Ben House trong Rapture-Palooza. Daley tiếp tục viết truyện cho phần tiếp theo của Horrible Bosses.

Daley và Goldstein đã đồng sáng tác và đạo diễn bộ phim Vacation, bộ phim mới nhất của bộ phim Vacation, với sự tham gia của Ed Helms và Christina Applegate.

Daley và Goldstein đã viết kịch bản cho bộ phim Spider-Man: Homecoming năm 2017 với bốn nhà làm phim khác.[9]

Năm 2018, bộ đôi này đang đàm phán để chỉ đạo một bộ phim chuyển thể từ Flashpoint của DC Comics cho DC Extended Universe của họ.[10].

Daley góp mặt trong video bài hát "Mercy Kiss" của Abandoned Pools.